Brussels Airlines opera circa 300 voli giornalieri, collegando Bruxelles con oltre 90 destinazioni in Europa e Africa, oltre a tre destinazioni in Nord America (New York JFK, Washington D.C. e Toronto).
Sulle sue rotte europee, operate principalmente con Airbus A319/A320, Brussels Airlines offre la scelta tra Check&Go, Light&Relax, Flex&Fast e Bizz&Class.
Oltre alle sue 20 destinazioni a lungo raggio in Africa e Nord America, Brussels Airlines e i suoi partner intercontinentali offrono anche voli in codeshare a lungo raggio verso gli Emirati Arabi Uniti, la Cina, la Thailandia e altre destinazioni in Nord America.